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參考

演算法筆記

我記得好像我在上課都精神不濟...

演算法的課不是在早8就是在早上9點啊...

 

在一堆 sequence 當中,每個 sequence 都有出現、最長的 subsequence ,就是「最長共同子序列」。

就是在一堆字裡面,總會有最長的相似子字串

 

舉例

擷取  

這是我用前面網址提供的實作完成後截出來的圖

 

先由左而右,再由上而下比較

不一樣的話,比較左邊和上面,選擇較大的數字,箭頭往上,

遇到相同的設成左邊和上面的數字取較大者+1,箭頭設成左上

當表格建立完後,從右下角開始順著箭頭走,有相同左上的箭頭連在一起最長的就是答案

 

大推 演算法筆記 這個網站

 

再來是2-sequence alignment

IMAG1798  

這是老師上課的,PO出來算違反智慧財產權的投影片

其實和上面那個很像

不相同-1,相同+3

畫斜線是老師為了提醒相同

兩條槓是最後走出來的

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